Über diesen Kurs
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100 % online

Beginnen Sie sofort und lernen Sie in Ihrem eigenen Tempo.

Flexible Fristen

Setzen Sie Fristen gemäß Ihrem Zeitplan zurück.

Stufe „Mittel“

Ca. 14 Stunden zum Abschließen

Empfohlen: 4-5 hours/week...

Englisch

Untertitel: Englisch

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Lehrplan - Was Sie in diesem Kurs lernen werden

Woche
1
2 Stunden zum Abschließen

The Library of Integrated Network-based Cellular Signatures (LINCS) Program Overview

This module provides an overview of the concept behind the LINCS program; and tutorials on how to get started with using the LINCS L1000 dataset.

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8 Videos (Gesamt 78 min), 2 Lektüren
8 Videos
The Connectivity Map8m
Geometrical View of the Connectivity Map Concept3m
LINCS Data and Signature Generation Centers12m
BD2K-LINCS Data Coordination and Integration Center4m
Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs)4m
Introduction to LINCS L1000 Data22m
L1000 Characteristic Direction Signature Search Engine (L1000CDS2) Demo13m
2 Lektüren
Syllabus10m
Grading and Logistics10m
26 Minuten zum Abschließen

Metadata and Ontologies

This module includes a broad high level description of the concepts behind metadata and ontologies and how these are applied to LINCS datasets.

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2 Videos (Gesamt 26 min)
2 Videos
Introduction to Metadata and Ontologies | Part 220m
24 Minuten zum Abschließen

Serving Data with APIs

In this module we explain the concept of accessing data through an application programming interface (API).

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2 Videos (Gesamt 19 min)
2 Videos
Accessing and Serving Data through RESTful APIs | Part 210m
Woche
2
19 Minuten zum Abschließen

Bioinformatics Pipelines

This module describes the important concept of a Bioinformatics pipeline.

...
1 Video (Gesamt 14 min)
1 Stunde zum Abschließen

The Harmonizome

This module describes a project that integrates many resources that contain knowledge about genes and proteins. The project is called the Harmonizome, and it is implemented as a web-server application available at: http://amp.pharm.mssm.edu/Harmonizome/

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4 Videos (Gesamt 37 min)
4 Videos
Processing Datasets | Part 18m
Processing Datasets | Part 29m
Processing Datasets | Part 37m
Woche
3
24 Minuten zum Abschließen

Data Normalization

This module describes the mathematical concepts behind data normalization.

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2 Videos (Gesamt 19 min)
2 Videos
Data Normalization | Part 213m
1 Stunde zum Abschließen

Data Clustering

This module describes the mathematical concepts behind data clustering, or in other words unsupervised learning - the identification of patterns within data without considering the labels associated with the data.

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3 Videos (Gesamt 33 min)
3 Videos
Data Clustering | Part 2 | Distance Functions 12m
Data Clustering | Part 3 | Algorithms and Evaluation15m
2 Stunden zum Abschließen

Midterm Exam

The Midterm Exam consists of 45 multiple choice questions which covers modules 1-7. Some of the questions may require you to perform some analysis with the methods you learned throughout the course on new datasets.

...
1 Quiz
1 praktische Übung
Midterm Exam1h 30m
Woche
4
29 Minuten zum Abschließen

Enrichment Analysis

This module introduces the important concept of performing gene set enrichment analyses. Enrichment analysis is the process of querying gene sets from genomics and proteomics studies against annotated gene sets collected from prior biological knowledge.

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3 Videos (Gesamt 29 min)
3 Videos
Enrichment Analysis | Part 27m
Enrichr Demo9m
1 Stunde zum Abschließen

Machine Learning

This module describes the mathematical concepts of supervised machine learning, the process of making predictions from examples that associate observations/features/attribute with one or more properties that we wish to learn/predict.

...
3 Videos (Gesamt 27 min)
3 Videos
Introduction to Machine Learning | Part 2 8m
Introduction to Machine Learning | Part 39m
4.9
4 BewertungenChevron Right

Top reviews from Big Data Science with the BD2K-LINCS Data Coordination and Integration Center

von MSJan 21st 2017

A very practical courses. Very good introduction to Big Data sources and Computational Analysis tool.

von HHSep 19th 2018

excellent oppurtunity for the data science learners

Dozent

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Avi Ma’ayan, PhD

Director, Mount Sinai Center for Bioinformatics
Professor, Department of Pharmacological Sciences

Über Icahn School of Medicine at Mount Sinai

The Icahn School of Medicine at Mount Sinai, in New York City is a leader in medical and scientific training and education, biomedical research and patient care....

Häufig gestellte Fragen

  • Sobald Sie sich für ein Zertifikat angemeldet haben, haben Sie Zugriff auf alle Videos, Quizspiele und Programmieraufgaben (falls zutreffend). Aufgaben, die von anderen Kursteilnehmern bewertet werden, können erst dann eingereicht und überprüft werden, wenn Ihr Unterricht begonnen hat. Wenn Sie sich den Kurs anschauen möchten, ohne ihn zu kaufen, können Sie womöglich auf bestimmte Aufgaben nicht zugreifen.

  • Wenn Sie ein Zertifikat erwerben, erhalten Sie Zugriff auf alle Kursmaterialien, einschließlich bewerteter Aufgaben. Nach Abschluss des Kurses wird Ihr elektronisches Zertifikat zu Ihrer Seite „Errungenschaften“ hinzugefügt – von dort können Sie Ihr Zertifikat ausdrucken oder es zu Ihrem LinkedIn Profil hinzufügen. Wenn Sie nur lesen und den Inhalt des Kurses anzeigen möchten, können Sie kostenlos als Gast an dem Kurs teilnehmen.

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