Über diesen Kurs
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Stufe „Anfänger“

Ca. 13 Stunden zum Abschließen

Empfohlen: 12-18 hours videos and labs...

Englisch

Untertitel: Englisch

Kompetenzen, die Sie erwerben

Genetic AnalysisBioinformatics AnalysisEvolutionComparative Genomics

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Lehrplan - Was Sie in diesem Kurs lernen werden

Woche
1
3 Stunden zum Abschließen

NCBI/Blast I

In this module we'll be exploring the amazing resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information, run by the National Library of Medicine in the USA. We'll also be doing a Blast search to find similar sequences in the enormous NR sequence database. We can use similar sequences to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function.

...
4 Videos (Gesamt 52 min), 4 Lektüren, 1 Quiz
4 Videos
Summary
4 Lektüren
Acknowledgements10m
Course Logistics10m
Lecture Materials10m
Lab 1 -- Exploring NCBI1h 30m
1 praktische Übung
Lab 1 Quiz6m
Woche
2
3 Stunden zum Abschließen

Blast II/Comparative Genomics

In this module we'll continue exploring the incredible resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information. We will be performing several different kinds of Blast searches: BlastP, PSI-Blast, and Translated Blast. We can use similar sequences identified by such methods to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function. We'll also be comparing parts of the genomes of a couple of different species, to see how similar they are.

...
4 Videos (Gesamt 58 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
4 Videos
Summary
2 Lektüren
Lecture Materials10m
Lab 2 -- Advanced Blast and Comparative Genomics1h 30m
1 praktische Übung
Lab 2 Quiz6m
Woche
3
2 Stunden zum Abschließen

Multiple Sequence Alignments

In this module we'll be doing multiple sequence alignments with Clustal (as implemented in MEGA), DiAlign, and MAFFT. Multiple sequences alignments can tell you where in a sequence the conserved and variable regions are, which is important for understanding the biology of the sequences under investigation. It also has practical applications, such as being able to design PCR primers that will amplify sequences from a number of different species, for example.

...
4 Videos (Gesamt 42 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
4 Videos
Summary
2 Lektüren
Lecture Materials10m
Lab 3 -- Multiple Sequence Alignment1h 30m
1 praktische Übung
Lab 3 Quiz6m
Woche
4
10 Minuten zum Abschließen

Review: NCBI/Blast I, Blast II/Comparative Genetics, and Multiple Sequence Alignments

...
1 Quiz
1 praktische Übung
Quiz: Modules 1-310m
4.7
158 BewertungenChevron Right

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Top reviews from Bioinformatic Methods I

von EDApr 27th 2017

Great course. All lectures provide a biological context for the tools you learn in the labs. The labs themselves provide a great introduction to the many tools available for bioinformatic analysis.

von FJFeb 6th 2017

The videos were very clear on how to use various bioinformatic tools. I found no difficulty in understanding them. Really enjoyed the course. Looking forward to the next part of this course!

Dozent

Avatar

Nicholas James Provart

Professor
Cell & Systems Biology

Über University of Toronto

Established in 1827, the University of Toronto is one of the world’s leading universities, renowned for its excellence in teaching, research, innovation and entrepreneurship, as well as its impact on economic prosperity and social well-being around the globe. ...

Häufig gestellte Fragen

  • Sobald Sie sich für ein Zertifikat angemeldet haben, haben Sie Zugriff auf alle Videos, Quizspiele und Programmieraufgaben (falls zutreffend). Aufgaben, die von anderen Kursteilnehmern bewertet werden, können erst dann eingereicht und überprüft werden, wenn Ihr Unterricht begonnen hat. Wenn Sie sich den Kurs anschauen möchten, ohne ihn zu kaufen, können Sie womöglich auf bestimmte Aufgaben nicht zugreifen.

  • Wenn Sie ein Zertifikat erwerben, erhalten Sie Zugriff auf alle Kursmaterialien, einschließlich bewerteter Aufgaben. Nach Abschluss des Kurses wird Ihr elektronisches Zertifikat zu Ihrer Seite „Errungenschaften“ hinzugefügt – von dort können Sie Ihr Zertifikat ausdrucken oder es zu Ihrem LinkedIn Profil hinzufügen. Wenn Sie nur lesen und den Inhalt des Kurses anzeigen möchten, können Sie kostenlos als Gast an dem Kurs teilnehmen.

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