Large-scale biology projects such as the sequencing of the human genome and gene expression surveys using RNA-seq, microarrays and other technologies have created a wealth of data for biologists. However, the challenge facing scientists is analyzing and even accessing these data to extract useful information pertaining to the system being studied. This course focuses on employing existing bioinformatic resources – mainly web-based programs and databases – to access the wealth of data to answer questions relevant to the average biologist, and is highly hands-on.
Dieser Kurs ist Teil der Spezialisierung Spezialisierung Plant Bioinformatic Methods
von
Spezialisierung Plant Bioinformatic MethodsUniversity of TorontoÜber diesen Kurs
127,197 kürzliche Aufrufe
Karriereergebnisse der Lernenden
24%
nahm einen neuen Beruf nach Abschluss dieser Kurse auf
30%
ziehen Sie für Ihren Beruf greifbaren Nutzen aus diesem Kurs
17%
erhalten Sie eine Gehaltserhöhung oder Beförderung
Zertifikat zur Vorlage
Erhalten Sie nach Abschluss ein Zertifikat
100 % online
Beginnen Sie sofort und lernen Sie in Ihrem eigenen Tempo.
Kurs 1 von 4 in
Flexible Fristen
Setzen Sie Fristen gemäß Ihrem Zeitplan zurück.
Stufe „Anfänger“
Ca. 20 Stunden zum Abschließen
Englisch
Untertitel: Englisch
Kompetenzen, die Sie erwerben
Genetic AnalysisBioinformatics AnalysisEvolutionComparative Genomics
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Englisch
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University of Toronto
Established in 1827, the University of Toronto is one of the world’s leading universities, renowned for its excellence in teaching, research, innovation and entrepreneurship, as well as its impact on economic prosperity and social well-being around the globe.
Lehrplan - Was Sie in diesem Kurs lernen werden
3 Stunden zum Abschließen
NCBI/Blast I
In this module we'll be exploring the amazing resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information, run by the National Library of Medicine in the USA. We'll also be doing a Blast search to find similar sequences in the enormous NR sequence database. We can use similar sequences to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function.
3 Stunden zum Abschließen
4 Videos (Gesamt 51 min), 4 Lektüren, 1 Quiz
4 Lektüren
Acknowledgements10m
Course Logistics10m
Lecture Materials10m
Lab 1 -- Exploring NCBI1h 30m
1 praktische Übung
Lab 1 Quiz30m
3 Stunden zum Abschließen
Blast II/Comparative Genomics
In this module we'll continue exploring the incredible resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information. We will be performing several different kinds of Blast searches: BlastP, PSI-Blast, and Translated Blast. We can use similar sequences identified by such methods to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function. We'll also be comparing parts of the genomes of a couple of different species, to see how similar they are.
3 Stunden zum Abschließen
4 Videos (Gesamt 58 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
2 Lektüren
Lecture Materials10m
Lab 2 -- Advanced Blast and Comparative Genomics1h 30m
1 praktische Übung
Lab 2 Quiz30m
3 Stunden zum Abschließen
Multiple Sequence Alignments
In this module we'll be doing multiple sequence alignments with Clustal (as implemented in MEGA), DiAlign, and MAFFT. Multiple sequences alignments can tell you where in a sequence the conserved and variable regions are, which is important for understanding the biology of the sequences under investigation. It also has practical applications, such as being able to design PCR primers that will amplify sequences from a number of different species, for example.
3 Stunden zum Abschließen
4 Videos (Gesamt 44 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
2 Lektüren
Lecture Materials10m
Lab 3 -- Multiple Sequence Alignment1h 30m
1 praktische Übung
Lab 3 Quiz30m
1 Stunde zum Abschließen
Review: NCBI/Blast I, Blast II/Comparative Genetics, and Multiple Sequence Alignments
1 Stunde zum Abschließen
1 praktische Übung
Quiz: Modules 1-330m
Über den Spezialisierung Plant Bioinformatic Methods
The past 15 years have been exciting ones in plant biology. Hundreds of plant genomes have been sequenced, RNA-seq has enabled transcriptome-wide expression profiling, and a proliferation of "-seq"-based methods has permitted protein-protein and protein-DNA interactions to be determined cheaply and in a high-throughput manner. These data sets in turn allow us to generate hypotheses at the click of a mouse or tap of a finger.The Plant Bioinformatics Specialization on Coursera introduces core bioinformatic competencies and resources, such as NCBI's Genbank, Blast, multiple sequence alignments, phylogenetics in Bioinformatic Methods I, followed by protein-protein interaction, structural bioinformatics and RNA-seq analysis in Bioinformatic Methods II. In Plant Bioinformatics we cover 33 plant-specific online tools from genome browsers to transcriptomic data mining to promoter/network analyses and others. Last, a Plant Bioinformatics Capstone uses these tools to hypothesize a biological role for a gene of unknown function, summarized in a written lab report.This specialization is useful to any modern plant molecular biologist wanting to get a feeling for the incredible scope of data available to researchers. A small amount of R programming is introduced in Bioinformatic Methods II, but most of the tools are web applications. It is recommended that you have access to a laptop or desktop computer for running these as they may not work as mobile applications on your phone or tablet.
Häufig gestellte Fragen
Wann erhalte ich Zugang zu den Vorträgen und Aufgaben?
Sobald Sie sich für ein Zertifikat angemeldet haben, haben Sie Zugriff auf alle Videos, Quizspiele und Programmieraufgaben (falls zutreffend). Aufgaben, die von anderen Kursteilnehmern bewertet werden, können erst dann eingereicht und überprüft werden, wenn Ihr Unterricht begonnen hat. Wenn Sie sich den Kurs anschauen möchten, ohne ihn zu kaufen, können Sie womöglich auf bestimmte Aufgaben nicht zugreifen.
Was bekomme ich, wenn ich diese Spezialisierung abonniere?
Wenn Sie sich für den Kurs anmelden, erhalten Sie Zugriff auf alle Kurse der Spezialisierung und Sie erhalten nach Abschluss aller Arbeiten ein Zertifikat. Ihr elektronisches Zertifikat wird zu Ihrer Seite „Errungenschaften“ hinzugefügt – von dort können Sie Ihr Zertifikat ausdrucken oder es zu Ihrem LinkedIn Profil hinzufügen. Wenn Sie nur lesen und den Inhalt des Kurses anzeigen möchten, können Sie kostenlos als Gast an dem Kurs teilnehmen.
Wie erfolgen Rückerstattungen?
Wenn Sie ein Abonnement abgeschlossen haben, erhalten Sie eine 7-tägige, kostenlose Testversion, die Sie gebührenfrei wieder kündigen können. Danach gewähren wir keine Rückerstattungen mehr, aber Sie können Ihr Abonnement jederzeit kündigen. Lesen Sie unsere vollständige Rückerstattungsrichtlinie.
Ist finanzielle Unterstützung möglich?
Ja, Coursera bietet für Kursteilnehmer, die sich die Kursgebühr nicht leisten können, finanzielle Unterstützung an. Bewerben Sie sich dafür, indem Sie auf den Link für finanzielle Unterstützung links unter der Schaltfläche „Anmelden“ klicken. Sie werden zum Ausfüllen eines Antrags aufgefordert und werden bei Genehmigung benachrichtigt. Diesen Schritt müssen Sie für jeden Kurs der Spezialisierung ausführen, auch für das Abschlussprojekt. Mehr erfahren
Erhalte ich akademische Leistungspunkte für den Abschluss des Kurses?
Für diesen Kurs gibt es keine akademischen Leistungspunkte, doch Hochschulen können nach eigenem Ermessen Leistungspunkte für Kurszertifikate vergeben. Wenden Sie sich an Ihre Einrichtung, um mehr zu erfahren. Online-Abschlüsse und Mastertrack™-Zertifikate auf Coursera bieten die Möglichkeit, akademische Leistungspunkte zu erwerben.
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