Über diesen Kurs
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133 Bewertungen

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Ca. 12 Stunden zum Abschließen

Englisch

Untertitel: Englisch

Kompetenzen, die Sie erwerben

BioinformaticsData AnalysisGenomeGenomics

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Lehrplan - Was Sie in diesem Kurs lernen werden

Woche
1
1 Stunde zum Abschließen

Introduction

This week, we will present some of the research challenges that motivated the development of the Galaxy framework. We will then introduce Galaxy, describe what the Galaxy framework is, and look at different ways you can use it....
2 Videos (Gesamt 13 min), 4 Lektüren, 1 Quiz
2 Videos
Introduction to the Galaxy Platform5m
4 Lektüren
Welcome10m
Syllabus10m
Pre-Course Survey10m
A Note about AWS10m
1 praktische Übung
Module 1 Quiz22m
Woche
2
2 Stunden zum Abschließen

Galaxy 101

In this module and the following modules we will start to use Galaxy to perform different types of analysis. ...
3 Videos (Gesamt 42 min), 1 Quiz
3 Videos
Galaxy 101: Workflows12m
Annotation, Sharing, and Publishing13m
1 praktische Übung
Module 2 Quiz56m
Woche
3
1 Stunde zum Abschließen

Working with sequence data

In this module we will be studying sequence data quality control as well as ChIP-Sequence Analysis with MACS....
2 Videos (Gesamt 25 min), 1 Quiz
2 Videos
ChIP-Sequence Analysis with MACS14m
1 praktische Übung
Module 3 Quiz18m
Woche
4
4 Stunden zum Abschließen

RNA-seq & Running your own Galaxy

In these final modules, we'll take a look at working with sequence data and RNA-seq and at installing and running your own Galaxy....
4 Videos (Gesamt 49 min), 2 Lektüren, 3 Quiz
4 Videos
RNA Sequence Analysis: Assembly Quantitation, and Differential Expression12m
Installing Galaxy Locally8m
Galaxy on the Cloud19m
2 Lektüren
TopHat availability10m
Post-Course Survey10m
2 praktische Übungen
Module 4 Quiz22m
Module 5 Quiz20m
3.7
133 BewertungenChevron Right

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Top-Bewertungen

von GKSep 6th 2018

This was a lot of work and rewarding to complete. The final project was challenging and the forum contributors helped a lot in pointing out good resources or strategies they had used.

von BGFeb 3rd 2018

Great Course if you are interested in dissecting the genome. Galaxy opens up this invisible world and allows even us little people to explore the world once reserved to only Academia.

Dozent

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James Taylor, PhD

Associate Professor of Biology and Computer Science

Über Johns Hopkins University

The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world....

Über die Spezialisierung Genomic Data Science

This specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, Python, R, Bioconductor, and Galaxy. The sequence is a stand alone introduction to genomic data science or a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics. To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit....
Genomic Data Science

Häufig gestellte Fragen

  • Sobald Sie sich für ein Zertifikat angemeldet haben, haben Sie Zugriff auf alle Videos, Quizspiele und Programmieraufgaben (falls zutreffend). Aufgaben, die von anderen Kursteilnehmern bewertet werden, können erst dann eingereicht und überprüft werden, wenn Ihr Unterricht begonnen hat. Wenn Sie sich den Kurs anschauen möchten, ohne ihn zu kaufen, können Sie womöglich auf bestimmte Aufgaben nicht zugreifen.

  • Wenn Sie sich für den Kurs anmelden, erhalten Sie Zugriff auf alle Kurse der Spezialisierung und Sie erhalten nach Abschluss aller Arbeiten ein Zertifikat. Ihr elektronisches Zertifikat wird zu Ihrer Seite „Errungenschaften“ hinzugefügt – von dort können Sie Ihr Zertifikat ausdrucken oder es zu Ihrem LinkedIn Profil hinzufügen. Wenn Sie nur lesen und den Inhalt des Kurses anzeigen möchten, können Sie kostenlos als Gast an dem Kurs teilnehmen.

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