Learn to use the tools that are available from the Galaxy Project. This is the second course in the Genomic Big Data Science Specialization.
Dieser Kurs ist Teil der Spezialisierung Spezialisierung Genomic Data Science
von
Spezialisierung Genomic Data ScienceJohns Hopkins UniversityÜber diesen Kurs
49,129 kürzliche Aufrufe
Karriereergebnisse der Lernenden
20%
nahm einen neuen Beruf nach Abschluss dieser Kurse auf
14%
ziehen Sie für Ihren Beruf greifbaren Nutzen aus diesem Kurs
Zertifikat zur Vorlage
Erhalten Sie nach Abschluss ein Zertifikat
100 % online
Beginnen Sie sofort und lernen Sie in Ihrem eigenen Tempo.
Kurs 2 von 8 in
Flexible Fristen
Setzen Sie Fristen gemäß Ihrem Zeitplan zurück.
Ca. 7 Stunden zum Abschließen
Englisch
Untertitel: Französisch, Portugiesisch (Brasilien), Russisch, Englisch, Spanisch
Kompetenzen, die Sie erwerben
BioinformaticsData AnalysisGenomeGenomics
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Englisch
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von
Johns Hopkins University
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
Lehrplan - Was Sie in diesem Kurs lernen werden
1 Stunde zum Abschließen
Introduction
This week, we will present some of the research challenges that motivated the development of the Galaxy framework. We will then introduce Galaxy, describe what the Galaxy framework is, and look at different ways you can use it.
1 Stunde zum Abschließen
2 Videos (Gesamt 13 min), 4 Lektüren, 1 Quiz
4 Lektüren
Welcome10m
Syllabus10m
Pre-Course Survey10m
A Note about AWS10m
1 praktische Übung
Module 1 Quiz30m
1 Stunde zum Abschließen
Galaxy 101
In this module and the following modules we will start to use Galaxy to perform different types of analysis.
1 Stunde zum Abschließen
3 Videos (Gesamt 42 min)
3 Videos
Galaxy 101: Workflows12m
Annotation, Sharing, and Publishing13m
1 praktische Übung
Module 2 Quiz30m
1 Stunde zum Abschließen
Working with sequence data
In this module we will be studying sequence data quality control as well as ChIP-Sequence Analysis with MACS.
1 Stunde zum Abschließen
2 Videos (Gesamt 25 min)
1 praktische Übung
Module 3 Quiz30m
3 Stunden zum Abschließen
RNA-seq & Running your own Galaxy
In these final modules, we'll take a look at working with sequence data and RNA-seq and at installing and running your own Galaxy.
3 Stunden zum Abschließen
4 Videos (Gesamt 49 min), 2 Lektüren, 3 Quiz
4 Videos
RNA Sequence Analysis: Assembly Quantitation, and Differential Expression12m
Installing Galaxy Locally8m
Galaxy on the Cloud19m
2 Lektüren
TopHat availability10m
Post-Course Survey10m
2 praktische Übungen
Module 4 Quiz30m
Module 5 Quiz30m
Bewertungen
Top-Bewertungen von GENOMIC DATA SCIENCE WITH GALAXY
von DT25. Aug. 2017
Highly instructive course on using Galaxy. Gives a very good flavour of the benefits, actual workflows and even a bit of administration in terms of installing your own version or a cloud version.
von BG2. Feb. 2018
Great Course if you are interested in dissecting the genome. Galaxy opens up this invisible world and allows even us little people to explore the world once reserved to only Academia.
von GK5. Sep. 2018
This was a lot of work and rewarding to complete. The final project was challenging and the forum contributors helped a lot in pointing out good resources or strategies they had used.
von RC11. Juni 2016
Great instructor with clear and thorough understanding of the material. If you don't have any experience with this technology, this course will walk you through it patiently.
Über den Spezialisierung Genomic Data Science
With genomics sparks a revolution in medical discoveries, it becomes imperative to be able to better understand the genome, and be able to leverage the data and information from genomic datasets. Genomic Data Science is the field that applies statistics and data science to the genome.
Häufig gestellte Fragen
Wann erhalte ich Zugang zu den Vorträgen und Aufgaben?
Der Zugang zu Vorlesungen und Aufgaben hängt von der Art Ihrer Anmeldung ab. Wenn Sie einen Kurs im Gastmodus belegen, können Sie die meisten Kursmaterialien kostenlos einsehen. Um auf benotete Aufgaben zuzugreifen und ein Zertifikat zu erhalten, müssen Sie während oder nach Ihrer Gastphase das Zertifikat erwerben. Wenn Sie die Gastoption nicht sehen:
- Der Kurs bietet möglicherweise keine Gastoption an. Sie können stattdessen eine kostenlose Testversion ausprobieren oder finanzielle Unterstützung beantragen.
- Der Kurs kann stattdessen "Vollständiger Kurs ohne Zertifikat" anbieten. Mit dieser Option können Sie alle Kursmaterialien einsehen, die erforderlichen Aufgaben einreichen und eine Endnote erhalten. Dies bedeutet auch, dass Sie kein Zertifikat erwerben können.
Was bekomme ich, wenn ich diese Spezialisierung abonniere?
Wenn Sie sich für den Kurs anmelden, erhalten Sie Zugriff auf alle Kurse der Spezialisierung und Sie erhalten nach Abschluss aller Arbeiten ein Zertifikat. Ihr elektronisches Zertifikat wird zu Ihrer Seite „Errungenschaften“ hinzugefügt – von dort können Sie Ihr Zertifikat ausdrucken oder es zu Ihrem LinkedIn Profil hinzufügen. Wenn Sie nur lesen und den Inhalt des Kurses anzeigen möchten, können Sie kostenlos als Gast an dem Kurs teilnehmen.
Is financial aid available?
Ja, Coursera bietet für Kursteilnehmer, die sich die Kursgebühr nicht leisten können, finanzielle Unterstützung an. Bewerben Sie sich dafür, indem Sie auf den Link für finanzielle Unterstützung links unter der Schaltfläche „Anmelden“ klicken. Sie werden zum Ausfüllen eines Antrags aufgefordert und werden bei Genehmigung benachrichtigt. Diesen Schritt müssen Sie für jeden Kurs der Spezialisierung ausführen, auch für das Abschlussprojekt. Mehr erfahren
Haben Sie weitere Fragen? Besuchen Sie das Hilfe-Center für Teiln..
