Über diesen Kurs
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Beginnen Sie sofort und lernen Sie in Ihrem eigenen Tempo.

Flexible Fristen

Setzen Sie Fristen gemäß Ihrem Zeitplan zurück.

Ca. 21 Stunden zum Abschließen

Empfohlen: 8 weeks of study, 2-4 hours/week...

Englisch

Untertitel: Englisch

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Lehrplan - Was Sie in diesem Kurs lernen werden

Woche
1
1 Stunde zum Abschließen

Introduction

In this first week, we'll introduce the project and get you oriented to the tasks that you'll be performing over the next several weeks. ...
1 Video (Gesamt 3 min), 6 Lektüren
6 Lektüren
Welcome10m
The big question10m
What you will be doing in this capstone project10m
Passing the Capstone10m
Why re-analysis?10m
Why is this so hard?10m
Woche
2
1 Stunde zum Abschließen

Introduction to the Dataset - Andrew Jaffe

This week, we'll really dig into the dataset by providing an introduction from Andrew Jaffe, the lead scientist on the analysis. You should also be looking ahead to Task 2, which is due in Week 4; the alignment will take a long time to perform, so you should start early....
1 Video (Gesamt 4 min), 3 Lektüren
3 Lektüren
Phenotype information10m
Getting the data from SRA10m
Which samples to use10m
Woche
3
1 Stunde zum Abschließen

Understand the Problem

The purpose of genomic data science is to answer fundamental questions in biology. Before starting on the data analysis process, the first step is always to understand the scientific question you are trying to answer. Don't forget to stay on top of the alignment task due in Week 4; it will take a long time to accomplish and shouldn't be put off....
1 Video (Gesamt 7 min), 1 Lektüre, 1 Quiz
1 Lektüre
Task 1 Instructions10m
1 praktische Übung
Understand the problem18m
Woche
4
2 Stunden zum Abschließen

Alignment

Once you have understood the problem, the next step is to obtain the raw data so that you can perform your analysis. ...
1 Quiz
Woche
5
2 Stunden zum Abschließen

QC the Alignment

Now you have aligned the data, the next step is to do some quality control to make sure that the data are in good shape. ...
1 Quiz
Woche
6
2 Stunden zum Abschließen

Get Feature Counts

Now that you have performed alignment and quality control, the next step is to calculate the abundance of every gene in every sample....
1 Quiz
Woche
7
2 Stunden zum Abschließen

Exploratory Analysis

After summarizing your genomic data the next step is to load the data into R for analysis with Bioconductor....
1 Quiz
Woche
8
2 Stunden zum Abschließen

Statistical Analysis

The next step is to perform a statistical analysis to detect genes that are differentially expressed. ...
1 Quiz
Woche
9
4 Stunden zum Abschließen

Gene Set Analysis

In task 6, we have identified genes differentially expressed between fetal and adult brain. Now we will examine these results in a wider context. ...
2 Quiz
Woche
10
2 Stunden zum Abschließen

Describe Your Analysis

The next step is to document your work. One of the major issues in genomic data science is that there are so many steps in the process. If these steps are not documented well the result can be major problems. ...
1 Quiz
4.6
12 BewertungenChevron Right

Top-Bewertungen

von FAJul 24th 2016

Great course! I can't think of a better way of putting together all we learned during the whole specialisation in one real world research project...

von PSDec 20th 2018

An excellent challenge. Previous courses everything was neatly packaged before you start. This course teaches you how to get there.

Dozenten

Avatar

Jeff Leek, PhD

Associate Professor, Biostatistics
Bloomberg School of Public Health
Avatar

Kasper Daniel Hansen, PhD

Assistant Professor, Biostatistics and Genetic Medicine
Bloomberg School of Public Health

Über Johns Hopkins University

The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world....

Über die Spezialisierung Genomic Data Science

This specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, Python, R, Bioconductor, and Galaxy. The sequence is a stand alone introduction to genomic data science or a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics. To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit....
Genomic Data Science

Häufig gestellte Fragen

  • Sobald Sie sich für ein Zertifikat angemeldet haben, haben Sie Zugriff auf alle Videos, Quizspiele und Programmieraufgaben (falls zutreffend). Aufgaben, die von anderen Kursteilnehmern bewertet werden, können erst dann eingereicht und überprüft werden, wenn Ihr Unterricht begonnen hat. Wenn Sie sich den Kurs anschauen möchten, ohne ihn zu kaufen, können Sie womöglich auf bestimmte Aufgaben nicht zugreifen.

  • Wenn Sie sich für den Kurs anmelden, erhalten Sie Zugriff auf alle Kurse der Spezialisierung und Sie erhalten nach Abschluss aller Arbeiten ein Zertifikat. Ihr elektronisches Zertifikat wird zu Ihrer Seite „Errungenschaften“ hinzugefügt – von dort können Sie Ihr Zertifikat ausdrucken oder es zu Ihrem LinkedIn Profil hinzufügen. Wenn Sie nur lesen und den Inhalt des Kurses anzeigen möchten, können Sie kostenlos als Gast an dem Kurs teilnehmen.

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