Über diesen Kurs
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100 % online

Beginnen Sie sofort und lernen Sie in Ihrem eigenen Tempo.

Flexible Fristen

Setzen Sie Fristen gemäß Ihrem Zeitplan zurück.

Stufe „Mittel“

Ca. 12 Stunden zum Abschließen

Empfohlen: 4 weeks of study, 2-4 hours/week...

Englisch

Untertitel: Englisch

Kompetenzen, die Sie erwerben

Image ProcessingBrainR ProgrammingNeurology

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Ca. 12 Stunden zum Abschließen

Empfohlen: 4 weeks of study, 2-4 hours/week...

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Lehrplan - Was Sie in diesem Kurs lernen werden

Woche
1
1 Stunde zum Abschließen

Introduction

...
3 Videos (Gesamt 30 min), 1 Lektüre, 1 Quiz
1 Lektüre
Syllabus10m
1 praktische Übung
Theme 1 Quiz16m
Woche
2
2 Stunden zum Abschließen

Neuroimaging: Formats and Visualization

In this section, we will discuss different formats that brain images come in, as well as some of the commonly done magnetic resonance imaging (MRI) scans.

...
7 Videos (Gesamt 74 min), 6 Quiz
7 Videos
Basic Visualization 29m
Basic Data Manipulation9m
Transformations and Smoothing14m
Basic MRI Contrasts9m
6 praktische Übungen
Theme 2 Lecture 1 Quiz10m
Theme 2 Lecture 2 Quiz10m
Theme 2 Lecture 3 Quiz10m
Theme 2 Lecture 4 Quiz10m
Theme 2 Lecture 5 Quiz10m
Theme 2 Lecture 6 Quiz10m
Woche
3
3 Stunden zum Abschließen

Image Processing

In this section, we will discuss the steps done to process brain MRI data. We will discuss inhomogeneity correction, brain extraction or skull stripping, and various image registration techniques.

...
9 Videos (Gesamt 71 min), 9 Quiz
9 Videos
Bias Field Correction Using fslr3m
Brain Extraction using fslr5m
Image Registration Using fslr5m
Installing ANTsR5m
Basic Data Manipulation with ANTsR4m
Pre-Processing with ANTSR7m
9 praktische Übungen
Theme 3 Quiz 110m
Theme 3 Quiz 210m
Theme 3 Quiz 312m
Theme 3 Quiz 410m
Theme 3 Quiz 510m
Theme 3 Quiz 610m
Theme 3 Quiz 710m
Theme 3 Quiz 810m
Theme 3 Quiz 910m
Woche
4
3 Stunden zum Abschließen

Extended Image Processing

In this section, we will discuss the different types of registration and how one would go through processing a multi-sequence MRI scan, as well as wrapper functions that make the process much easier. We also cover interactive exploration of brain image data and tissue-level (white/gray matter and cerebrospinal fluid (CSF)) segmentation from a T1-weighted image.

...
11 Videos (Gesamt 101 min), 1 Lektüre, 10 Quiz
11 Videos
Wrapper Functions for Processing Pipelines8m
Across-Visit Co-Registration of T1 Images6m
Rigid Registration to a Template8m
Affine Registration of T1 to Template4m
Nonlinear Registration of T1 to Template6m
Getting ROI Anatomic Information from Non-Linear Registration12m
Tissue-Level Segmentation7m
Papayar: Interactively Viewing Images in R22m
1 Lektüre
Papayar Script10m
10 praktische Übungen
Theme 4 Quiz 110m
Theme 4 Quiz 210m
Theme 4 Quiz 36m
Theme 4 Quiz 410m
Theme 4 Quiz 510m
Theme 4 Quiz 610m
Theme 4 Quiz 710m
Theme 4 Quiz 810m
Theme 4 Quiz 910m
Theme 4 Quiz 1010m
4.6
29 BewertungenChevron Right

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Top reviews from Introduction to Neurohacking In R

von BRFeb 9th 2017

I like that this course goes through most necessary steps, my only suggest would be to have one additional week where you go through everything all together, and then do some simple group analysis.

von SJMay 8th 2019

Thank you for the wonderful course. Especially useful when the team explains every new line of code. As a current undergraduate and aspiring neuroscience researcher, this is tremendously helpful.

Dozenten

Avatar

Dr. Elizabeth Sweeney

Rice Academy Postdoctoral Fellow
Biostatistics
Avatar

Ciprian M. Crainiceanu

Professor
Biostatstics
Avatar

John Muschelli III

Assistant Scientist
Biostatistics

Über Johns Hopkins University

The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world....

Häufig gestellte Fragen

  • Sobald Sie sich für ein Zertifikat angemeldet haben, haben Sie Zugriff auf alle Videos, Quizspiele und Programmieraufgaben (falls zutreffend). Aufgaben, die von anderen Kursteilnehmern bewertet werden, können erst dann eingereicht und überprüft werden, wenn Ihr Unterricht begonnen hat. Wenn Sie sich den Kurs anschauen möchten, ohne ihn zu kaufen, können Sie womöglich auf bestimmte Aufgaben nicht zugreifen.

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