Neurohacking describes how to use the R programming language (https://cran.r-project.org/) and its associated package to perform manipulation, processing, and analysis of neuroimaging data. We focus on publicly-available structural magnetic resonance imaging (MRI). We discuss concepts such as inhomogeneity correction, image registration, and image visualization.
Dieser Kurs ist Teil der Spezialisierung Spezialisierung Neuroscience and Neuroimaging
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Spezialisierung Neuroscience and NeuroimagingJohns Hopkins UniversityÜber diesen Kurs
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Kurs 4 von 4 in
Stufe „Mittel“
Ca. 18 Stunden zum Abschließen
Englisch
Untertitel: Französisch, Portugiesisch (europäisch), Russisch, Englisch, Spanisch
Kompetenzen, die Sie erwerben
Image ProcessingBrainR ProgrammingNeurology
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von
Johns Hopkins University
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
Lehrplan - Was Sie in diesem Kurs lernen werden
1 Stunde zum Abschließen
Introduction
1 Stunde zum Abschließen
3 Videos (Gesamt 30 min), 1 Lektüre, 1 Quiz
4 Stunden zum Abschließen
Neuroimaging: Formats and Visualization
In this section, we will discuss different formats that brain images come in, as well as some of the commonly done magnetic resonance imaging (MRI) scans.
4 Stunden zum Abschließen
7 Videos (Gesamt 74 min)
6 Stunden zum Abschließen
Image Processing
In this section, we will discuss the steps done to process brain MRI data. We will discuss inhomogeneity correction, brain extraction or skull stripping, and various image registration techniques.
6 Stunden zum Abschließen
9 Videos (Gesamt 71 min)
7 Stunden zum Abschließen
Extended Image Processing
In this section, we will discuss the different types of registration and how one would go through processing a multi-sequence MRI scan, as well as wrapper functions that make the process much easier. We also cover interactive exploration of brain image data and tissue-level (white/gray matter and cerebrospinal fluid (CSF)) segmentation from a T1-weighted image.
7 Stunden zum Abschließen
11 Videos (Gesamt 101 min), 1 Lektüre, 10 Quiz
Bewertungen
Top-Bewertungen von INTRODUCTION TO NEUROHACKING IN R
von BR8. Feb. 2017
I like that this course goes through most necessary steps, my only suggest would be to have one additional week where you go through everything all together, and then do some simple group analysis.
von SJ7. Mai 2019
Thank you for the wonderful course. Especially useful when the team explains every new line of code. As a current undergraduate and aspiring neuroscience researcher, this is tremendously helpful.
von SG28. Aug. 2020
The process of downloading packages on the virtual machine was very tiring. The documentation of it could have been provided more nicely. Like I was not aware about the 'sudo...'on LINUX.
von AN17. Juli 2017
Perfect! Precise to the subject and provides a lot of hands-on details, which is, unfortunately, something that most other similar courses don't do. Absolutely loved it!
Über den Spezialisierung Neuroscience and Neuroimaging
This specialization combines the strength of 4 different neuroscience courses into a cohesive learning experience. Taught by Johns Hopkins University, it begins with fundamental neuroscience concepts for neuroimaging. Neuroimaging methods are used with increasing frequency in clinical practice and basic research. Starting with the neuroanatomy of the brain, it then moves into principles of neuroimaging, including experimental design in neuroimaging, functional connectivity MRI, diffusion tensor imaging and spectroscopy imaging.
Häufig gestellte Fragen
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