3D SARS-CoV-19 Protein Visualization With Biopython

4.6
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von
Coursera Project Network
In diesem angeleitetes Projekt werden Sie:

Biological sequence/ Data manipulation with Biopython

Query Biological Databases using Biopython & web-scraping

Create an interactive 3D model of SARS-CoV-19 Protein

Clock2 hours
IntermediateMittel
CloudKein Download erforderlich
VideoVideo auf geteiltem Bildschirm
Comment DotsEnglisch
LaptopNur Desktop

In this project you will create an interactive three-dimensional (3D) representation of SARS-CoV-19 (Coronavirus) protein structures & publication-quality pictures of the same, understand properties of SARS-CoV-19 genome, handle biological sequence data stored in FASTA & PDB (Protein Data Bank) and XML format, and get insights from this data using Biopython. This hands-on project will also give you a glimpse of tasks a Bioinformatician performs on a daily basis, along with the up-to-date concepts and database use cases in the field of Medical Research and Human genetics. In this project, we will also cover basics about important databases used by biologists and biotechnologists, along with the type of sequence data we can access and visualize from these databases using Biopython & Jupyter notebook.

Kompetenzen, die Sie erwerben werden

  • SARS-CoV-19
  • Biopython
  • Python Programming
  • Bioinformatics
  • Biotechnology

Schritt für Schritt lernen

In einem Video, das auf einer Hälfte Ihres Arbeitsbereichs abgespielt wird, führt Sie Ihr Dozent durch diese Schritte:

  1. Introduction to Biopython

  2. Understand FASTA file format

  3. Sequence manipulation using Biopython

  4. Transcription & Translation studies

  5. Perform Basic Local Alignment using NCBI-BLAST

  6. Reading PDB file

  7. Visualizing SARS-CoV-19 Protein structures

Ablauf angeleiteter Projekte

Ihr Arbeitsbereich ist ein Cloud-Desktop direkt in Ihrem Browser, kein Download erforderlich

Ihr Dozent leitet Sie in einem Video mit geteiltem Bildschirm Schritt für Schritt an.

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