Über diesen Kurs
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Ca. 31 Stunden zum Abschließen

Empfohlen: 视频,补充材料和测验共20小时...

Chinesisch (vereinfacht)

Untertitel: Chinesisch (vereinfacht)

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Lehrplan - Was Sie in diesem Kurs lernen werden

Woche
1
2 Stunden zum Abschließen

导论与历史

欢迎选学“生物信息学:导论与方法”网上课程!完成本模块的课程后你将可以:熟悉生物信息学的基本概念;了解生物信息这一年轻领域的历史;体会生物信息学的迅猛发展。课程补充材料可以加深你对课程讲座内容的理解,虽然小测和考试对这些内容不作要求。...
4 Videos (Gesamt 67 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
4 Videos
什么是生物信息学 16m
生物信息学历史34m
中国大陆的生物信息学7m
2 Lektüren
阅读参考10m
讲义10m
1 praktische Übung
导论与历史20m
Woche
2
3 Stunden zum Abschließen

序列比对

完成本模块的课程后你将可以: 掌握基于动态规划编程思想的序列比对算法; 区分Needleman-Wunsch全局比对算法和Smith-Waterman局部比对算法; 了解空位罚分背后的原理和计算算法的复杂度将帮助你在你自己的研究中应用现有的生物信息学工具; 你还可以一睹Smith-Waterman算法的发明人Michael Waterman博士的风采。...
8 Videos (Gesamt 114 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
8 Videos
利用动态规划进行全局比对15m
从全局比对到局部比对6m
考虑仿射空位罚分的序列比对,以及如何计算Needleman-Wunsch算法的时间复杂度6m
关于同源、相似性、相似性矩阵和点阵图10m
M.S. Waterman教授访谈 29m
学生课堂报告(一)18m
学生课堂报告(二)11m
2 Lektüren
阅读参考10m
讲义10m
1 praktische Übung
序列比对18m
Woche
3
1 Stunde zum Abschließen

序列数据库搜索

完成本模块的课程后你将可以:熟悉序列数据库搜索和最常见的序列数据库;领略BLAST背后算法的奥妙;掌握日后在你自己的科研项目中调节BLAST参数的方法。...
3 Videos (Gesamt 37 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
3 Videos
BLAST算法初探10m
学生课堂报告15m
2 Lektüren
阅读参考10m
讲义10m
1 praktische Übung
序列数据库搜索10m
Woche
4
2 Stunden zum Abschließen

马尔可夫模型

完成本模块的课程后你将可以:了解状态转移、马尔科夫链、马尔科夫模型的基本概念;亲手完成一个隐马尔科夫模型;利用隐马尔可夫模型在一个实际的生物学问题中作出预测。...
7 Videos (Gesamt 70 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
7 Videos
隐马尔可夫模型 9m
用隐马尔可夫模型建立预测模型 8m
学生课堂报告(一)16m
学生课堂报告(二)11m
学生课堂报告(三)8m
学生实践8m
2 Lektüren
阅读参考10m
讲义10m
1 praktische Übung
马尔可夫模型14m
Woche
5
2 Stunden zum Abschließen

新一代测序NGS:重测序的回帖和变异鉴定

完成本模块的课程后你将可以:描述新一代测序的特点;了解你得到的NGS变异结果是用哪些序列回帖和变异鉴定方法完成的;亲历NGS数据分析流程,体会其中生物信息工具在NGS数据分析中的应用。本模块是模块7的先修模块。...
7 Videos (Gesamt 73 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
7 Videos
序列回帖和变异鉴定 13m
序列回帖和变异鉴定的分析演示7m
关于回帖、变异鉴定9m
关于基因型鉴定18m
Ion Torrent PGM测序介绍10m
3730 Sanger测序介绍3m
2 Lektüren
阅读参考10m
讲义10m
1 praktische Übung
新一代测序NGS:重测序的回帖和变异鉴定10m
Woche
6
2 Stunden zum Abschließen

变异的功能预测

完成本模块的课程后你将可以:了解什么是变异功能预测和如何进行变异功能预测;在你得到一些可能的变异位点时学会利用变异数据库解决自己的研究问题;了解变异预测工具(SIFT,Polyphen和SAPRED等)背后的机理差异并会在自己的研究课题中按需应用这些工具。...
6 Videos (Gesamt 100 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
6 Videos
记录变异的数据库11m
基于保守性和规则的预测方法:SIFT和PolyPhen21m
基于机器学习分类器的预测方法:SAPRED17m
支持向量机简介 18m
学生课堂报告 14m
2 Lektüren
阅读参考10m
讲义10m
1 praktische Übung
变异的功能预测14m
Woche
7
2 Stunden zum Abschließen

期中考试

...
1 Quiz
1 praktische Übung
期中考试40m
Woche
8
2 Stunden zum Abschließen

新一代测序NGS:转录组分析RNA-Seq

完成本模块的课程后你将可以:了解转录组数据是如何产生的;掌握转录组分析中的重要计算方法;体验RNA-seq的数据分析流程;本模块是模块9的先修模块。...
9 Videos (Gesamt 107 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
9 Videos
RNA测序数据回帖与组装10m
RNA-seq数据分析22m
Maynard Olson教授访谈 9m
学生课堂报告(一)13m
学生课堂报告(二)9m
学生课堂报告(三)8m
学生课堂报告(四)11m
学生实践9m
2 Lektüren
阅读参考10m
讲义10m
1 praktische Übung
新一代测序NGS:转录组分析RNA-Seq16m
Woche
9
2 Stunden zum Abschließen

非编码RNA的预测及分析

完成本模块的课程后你将可以:掌握从转录组数据中分析非编码RNA的方法;掌握从NGS数据中鉴定长非编码RNA(lncRNA)并预测其功能的方法。...
5 Videos (Gesamt 58 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
5 Videos
数据挖掘: 长非编码RNA的鉴定9m
数据挖掘: 差异表达与聚类分析10m
变量选择与聚类分析14m
Illumina HiSeq & MiSeq测序仪介绍13m
2 Lektüren
阅读参考10m
讲义10m
1 praktische Übung
非编码RNA的预测及分析14m
Woche
10
2 Stunden zum Abschließen

本体论、分子通路鉴定

完成本模块的课程后你将可以:了解本体论和基因本体轮等重要定义;了解KEGG通路数据库;了解GO的注释消息;在药物成瘾研究中学会使用KOBAS进行通路分析。...
8 Videos (Gesamt 84 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
8 Videos
KEGG分子通路数据库8m
GO注释7m
分子通路鉴定 18m
应用:药物成瘾共同分子通路的鉴定6m
数据库系统简介5m
KOBAS演示 7m
学生演示KOBAS9m
2 Lektüren
阅读参考10m
讲义10m
1 praktische Übung
本体论、分子通路鉴定12m
Woche
11
1 Stunde zum Abschließen

生物信息数据库及软件资源

完成本模块的课程后你将可以:高屋建瓴的去了解最重要的生物信息资源(生物信息数据库和软件工具等);对NCBI, EBI, UCSC 基因组浏览器这样集中型的生物信息资源与各种独立的生物信息资源的概况有广泛的了解和认识;将你的研究内容和相关生物信息资源联系在一起。...
6 Videos (Gesamt 58 min), 1 Lektüre, 1 Quiz
6 Videos
美国国家生物信息中心(NCBI)资源11m
欧洲生物信息中心(EBI)资源 10m
UCSC基因组浏览器5m
其他主要生物信息资源5m
学生介绍CBI资源8m
1 Lektüre
讲义10m
1 praktische Übung
生物信息数据库及软件资源10m
Woche
12
2 Stunden zum Abschließen

研究案例 I -- 新基因起源

完成本案例模块的课程后你将可以:体验生物信息数据、方法和分析是如何解决一个重要的演化问题的;领略物种特异性新基因的起源、演化、功能研究和分析方法;和享誉全球的新基因研究泰斗——芝加哥大学龙漫远教授一起学习建立系统发育树(选学)。...
5 Videos (Gesamt 89 min), 2 Lektüren, 1 Quiz
5 Videos
新基因鉴定及演化分析: 大脑演化的驱动力13m
从非编码RNA起源的从头起源新基因18m
一个与成瘾相关的人类特异的从头起源的新基因 11m
学生课堂报告12m
2 Lektüren
阅读参考10m
讲义10m
1 praktische Übung
新基因起源10m
Woche
13
1 Stunde zum Abschließen

研究案例II- DNA甲基化酶的演化功能分析

完成本案例模块的课程后你将可以:亲历生物信息学方法对DNA甲基化酶的功能和演化的研究;与中科院院士、同济大学校长裴刚教授一起分享科研经历和对网络开放课程的哲思。...
5 Videos (Gesamt 70 min), 1 Lektüre
5 Videos
从干实验到湿实验——一个演化问题 第2部分7m
裴钢教授关于研究背景的介绍25m
裴钢教授访谈20m
学生课堂报告 10m
1 Lektüre
讲义10m
Woche
14
1 Stunde zum Abschließen

期末考试

...
1 Quiz
1 praktische Übung
期末考试20m
4.7
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Top-Bewertungen

von FFOct 3rd 2015

课程对于入门还是不错的,讲了很多生物信息学所用到的理论和方法,但感觉有些问题可以再细致一些,比如二代测序的具体原理等等,总之是个不错的课程

von WSMar 28th 2016

Interesting and well organized , like it ~ xiexie nong ~

Dozenten

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Ge Gao 高歌, Ph.D.

Assistant Professor, Principle Investigator
Center for Bioinformatics, School of Life Science
Avatar

Liping Wei 魏丽萍, Ph.D.

Professor, Director
Center for Bioinformatics, School of Life Sciences

Über Peking University

Peking University is determined to make its education openly accessible to students in China and around the world. With over 3000 faculty members, Peking University offers excellence in teaching and learning. Founded in 1898, Peking University (PKU) was the first national comprehensive university in China. For the past 115 years, with its hundreds of thousands of outstanding alumni, Peking University has made prominent contributions in the humanities and sciences to further China's prosperity and progress....

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