Access Bioinformatics Databases with Biopython

von
Coursera Project Network
In diesem angeleitetes Projekt werden Sie:

Sequence alignment using NCBI-BLAST

Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ, PDB, EXPASY

Access KEGG pathways and genes

Clock1 hour
IntermediateMittel
CloudKein Download erforderlich
VideoVideo auf geteiltem Bildschirm
Comment DotsEnglisch
LaptopNur Desktop

In this 1-hour long project-based course, you will learn how to access, parse, and visualize data from various bioinformatics sequence and structural online databases such as ENTREZ, PDB, KEGG and NCBI using Biopython. You will also interact with various bioinformatics file formats such as FASTA, PDB, GENBANK and XML along with various parsers to read and modify these files using Biopython. Note: This course works best for learners who are based in the North America region. We’re currently working on providing the same experience in other regions.

Kompetenzen, die Sie erwerben werden

  • Bioinformatics
  • Python Programming
  • access biological database

Schritt für Schritt lernen

In einem Video, das auf einer Hälfte Ihres Arbeitsbereichs abgespielt wird, führt Sie Ihr Dozent durch diese Schritte:

  1. Sequence alignment using NCBI-BLAST

  2. Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ

  3. Fetch proteins from PDB

  4. PROSITE & SCANPROSITE from EXPASY

  5. Access KEGG database

Ablauf angeleiteter Projekte

Ihr Arbeitsbereich ist ein Cloud-Desktop direkt in Ihrem Browser, kein Download erforderlich

Ihr Dozent leitet Sie in einem Video mit geteiltem Bildschirm Schritt für Schritt an.

Häufig gestellte Fragen

Häufig gestellte Fragen

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