Über diesen Kurs

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Kompetenzen, die Sie erwerben

BioinformaticsBioconductorGenomicsR Programming
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Johns Hopkins University

Lehrplan - Was Sie in diesem Kurs lernen werden

Woche
1

Woche 1

3 Stunden zum Abschließen

Week One

3 Stunden zum Abschließen
16 Videos (Gesamt 126 min), 3 Lektüren, 1 Quiz
16 Videos
Installing R on A Mac 2m
Installing R Studio on a Mac 1m
What is Bioconductor7m
Installing Bioconductor3m
The Bioconductor Website9m
Useful Online Resources5m
R Base Types18m
GRanges - Overview4m
IRanges - Basic Usage12m
GenomicRanges - GRanges8m
GenomicRanges - Basic GRanges Usage8m
GenomicRanges - seqinfo6m
AnnotationHub8m
Usecase: AnnotationHub and GRanges, part 112m
Usecase: AnnotationHub and GRanges, part 213m
3 Lektüren
Welcome10m
Syllabus10m
Pre Course Survey10m
1 praktische Übung
Quiz 130m
Woche
2

Woche 2

2 Stunden zum Abschließen

Week Two

2 Stunden zum Abschließen
8 Videos (Gesamt 81 min)
8 Videos
BSgenome6m
Biostrings - Matching6m
BSgenome - Views9m
GenomicRanges - Rle12m
GenomicRanges - Lists6m
GenomicFeatures18m
rtracklayer - Data Import14m
1 praktische Übung
Quiz 230m
Woche
3

Woche 3

2 Stunden zum Abschließen

Week Three

2 Stunden zum Abschließen
9 Videos (Gesamt 79 min)
9 Videos
Annotation Overview4m
ExpressionSet Overview4m
ExpressionSet9m
SummarizedExperiment7m
GEOquery6m
biomaRt13m
R S4 Classes16m
R S4 Methods10m
1 praktische Übung
Quiz 330m
Woche
4

Woche 4

2 Stunden zum Abschließen

Week Four

2 Stunden zum Abschließen
7 Videos (Gesamt 81 min), 1 Lektüre, 1 Quiz
7 Videos
Short Read4m
Rsamtools12m
oligo14m
limma16m
minfi11m
Count-based RNA-seq analysis15m
1 Lektüre
Post Course Survey10m
1 praktische Übung
Quiz 430m

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